Я бы отвела больше времени на сам Киото (хотя бы 2 дня). В это время в некоторых храмах будет самый разгар момидзи (посмотрите тут:
http://www.japan-guide.com/e/e3953.html), этому стоит уделить время. Самые супер-пупер-мега-образцово-открыточные виды будут тут:
http://www.japan-guide.com/e/e3916.html (обязательно посетите Sanboin с его садом). В Окаяме в связи с момидзи стоит обязательно посетить Коракуэн. Примерно в Ваши даты там бывают поздние открытия с подсветкой.
На Коя-сан уже всё или почти всё облетит, стоит ли туда ехать - вопрос. Ради ночевки в монастыре, наверное, всё-таки стоит.
Однозначно выкинула бы Курасики, возможно, и Ивакуни. В Химэдзи оставила бы только замок, так Вы полдня точно сэкономите (хотя храм на Сёсядзан нежно люблю). Долина Ия - тоже спорно. Половину, если не больше, интересного (Oku Iya) Вы одним днём из Окаямы без машины не увидите. Но место очень привлекательное, конечно.
В общем, один из вариантов может быть таков:
1 день - Киото (ночь в Киото)
2 день - Киото (Киото)
3 день - Коя-сан (Коя-сан)
4 день - замок Химэдзи, Коракуэн в Окаяма (Окаяма)
5 день - долина Ия (Окаяма)
6 день - парк Мира в Хиросиме, Миядзима (Миядзима)
7 день - переезд в Фукуоку