Berlin Jungfernheide (S)
...
Berlin-Schöneberg
Berlin Südkreuz (S)
walk 5 min.
Berlin Südkreuz
Dresden-Neustadt
Dresden Hbf
Насколько я понял все поезда которые идут из Берлина проходят через Нойштадт. Мой похоже даже останавливается)) Только надо было прописать в электронном билете Дрезден Митте - система позволяет и цена не меняется. Так что ничуть не хуже чем автобусом на предварительном этапе. Есть вопросы по транспорта Дрездена, но, думаю, тут непрофильная тема
Upd: все IC, ICE останавливаются на Нойштадт, RE,RB - региональные не останавливаются.