Найти что-то дешевле и выгоднее JR-pass на мой взгляд невозможно.
Если только региональные пассы.
Других я не встречал.
Небогатые японцы чаще перемещаются междугородними автобусами, например ночными.
Например, мой знакомый проживающий в Киото, считает даже лимитед экспрессы недешёвыми, а синкансен для него расточительство.
Если бы у японцев была возможность купить для себя JR-pass, или что-то наподобие, как это доступно туристам, то они бы чаще ездили синкансенами и лимитед-экспрессами.
P.S.> Как мне показалось, некоторая определенная часть японцев считает, что если дорого, то это круто.
И поэтому комфорт и скорость прямопропорциональны цене проезда.
Это и разные по уровню комфорта автобусы.
И разные по скорости, уровню комфорта, поезда и разные градации вагонов поездов по уровню комфорта сидушек и свободному пространству вокруг себя.
Если бы это было неважно и не ценилось бы, это не предлагали бы. Т.е. есть спрос и есть предложение.
Извиняюсь за пространную поэму
P.P.S.> Если есть цель увидеть как можно больше в Японии за определенный срок, то Вам в этом помогут авиакомпании-лоукостеры и JR-pass.
За 2 недели можно очень недурно поколесить по Японии, если активно передвигаться.