Отсутствие опыта поездок по Европе. Помогите с маршрутом.

[Billy Milligan]

перелет Алматы-Мадрид-Алматы транзитом через Амстердам на KLM.

Это не значит, что билеты Алматы-Амстердам-Мадрид и Амстердам-Алматы будут значительно дешевле единого, проходящего через все пункты с соответствующими перелетами по каждому сегменту.
Попробуйте поиск по составному билету (без плеча Мадрид-Амстердам), главное, чтобы он был единым от KLM.
То есть, вы не сможете проигнорировать сегмент Мадрид-Амстердам, если он прописан у Вас в билете.

Перелет Алматы-(через Амстердам)-Мадрид-(через Амстердам)-Алматы не намного дешевле перелета Алматы-(через Амстердам)-Мадрид и Амстердам-Алматы.
Разница в рублях 4000.

[Degt]

В принципе, у Вас 20 дней. Должно хватить на все.
Только одну машину в Испании возьмите, а потом до Амстердама на общественном транспорте. Там вторую машину возьмете. Или еще узловых точек добавьте...

[Billy Milligan]

Или еще узловых точек добавьте...

Вот вот, узловые точки меня и интересуют. Как лучше всего это сделать на поезде/автобусе.

[Горыныч]

Как лучше всего это сделать на поезде/автобусе.

Вариантов миллион... Подумайте над тем, что интересно именно для Вас, составьте какой-нибудь маршрут и после этого выставляйте его для обсуждения.