Как следует из сути самой визы, она выдается для посещения стран ШС, для чего и дается сколько-то дней в тот или иной период, к чему время пребывания в Болгарии никакого отношения не имеет, хоть та и Евросоюзе, но не в ШС.
Вы удивитесь, но у болгар не только штампики на границе по своему виду повторяют штампы пограгслужб стран ШС, но и сама виза точная копия визы страны ШС.
Мне не представилось возможным понять, где и как Вы продлевали визу, а посему и вряд ли что-то можно сказать более по Вашему вопросу.
Однако представляется очевидным, что Вы можете столкнуться на границе с "человеческим фактором", когда на словах придется доказывать, что Болгария не входит в число стран - членов ШС.
С наилучшими пожеланиями...