День 2. Может сделать в несколько иной последовательности: Маленкая Венеция - на лодке до Камдена, оттуда Риджентс парк, из парка в музей Холмса и далее Тюссо.
День 4. Смотря, откуда начинать Доклендс. от аббатства можно на метро доехать до Тауэра, тогда - доки св. Катерины - пешком через Limehouse до Canary Wharf - оттуда на DLR можно доехать до Гринвича (остановка Cutty Sark). Либо начать с Shadwell (подъехать на LDR) - через Shadwell Basin до Limehouse - и дальше. Либо можно начать сразу с Limehouse. Из пабов в Гринвиче наверное можно порекомедовать известную Trafalgar Tavern - она на берегу Темзы. Из прибрежных есть еще Cutty Sark Tavern и Яхта (Yacht).
День 5. Паб сложно посоветовать = в пятницу вечером в центре везде будет многовато народу. Может что-то больше ресторанного типа? например, бельгийские пабы, там есть и английские эли, посидеть за столиком в отдельной, ресторанной комнате чтобы не толпится в общем помещении паба.
День 6. Времени достаточно.