Что касается криминала, лично мой африканский опыт небогат на ЧП, сталкивался с мелкими кражами и с обсчетом при обмене наличной валюты, не более того. Это за три с половиной года работы и две двухнедельные самостоятельные поездки. Гулял по ночам только в хорошо знакомых местах или в лесу, не в местах скопления туристов и не в трущобах. По Найроби ходил и ездил на общественном транспорте исключительно днем, к счастью время прилета-отлета не требовало иного. В Кампале был дважды, пришлось пересаживаться с автобуса на автобус вечером, оба раза доверился интуиции и постарался не задерживаться.
Ни в коей мере не сомневаюсь, что есть опасные места, и кое-какой опыт других людей описан на форуме в соответствующем разделе, хотя и далеко не так обильно, как по Латинской Америке. Безусловно не все хотят тебя сожрать, большинство людей просто живет своей жизнью и достаточно доброжелательны, но те, кто хочет как-то особенно нажиться, имеют тенденцию выделяться своей активностью в контактах с иностранцами, и есть смысл не идти у них на поводу -- например, не заходить в лавки, куда приглашают какие-то непонятные персонажи. А лучше вообще оставаться вне их поля зрения. К зазывалам на автостанциях это не относится -- это их нормальная работа.
В общем, я стараюсь придерживаться такой схемы: в день прилета, пока свеженький-тепленький, свести перемещения по городу к минимуму, только купить газовые баллоны и уехать за город, или иметь забронированную гостиницу в спокойном районе, заселиться в нее и уехать из города рано утром. Потом, поболтавшись по сельской местности и пообтеревшись, уже легче. Перед отлетом/отъездом уже можно заложить день на город, если интересно, он же запасной день на случай транспортных и прочих проблем.
Что касается проблем со здоровьем, климат Восточной и Южной Африки я бы в основном оценил как здоровый и приятный, но:
1) сделать привику от желтой лихорадки,
2) проработать вопрос профилактики малярии: одежда из синтетики с длинным рукавом, накомарники-сетки, репелленты, обязательна ли в этом регионе химиопрофилактика или можно без нее, и курс препарата для лечения иметь не помешает. Это основная реальная угроза во многих местах,
3) не купаться в пресных водоемах, кроме открытой воды вдали от берега в больших озерах и водохранилищах,
4) не питаться в заведениях, слишком дорогих для массового потока местных клиентов, иметь наготове свою горелку и газ и свою посуду, и свою воду.