Значит багаж (если есть) вам зарегистрируют до конечного пункта и должны выдать посадочный до конечного пункта.
По прибытию в Прагу, вы попадаете в Терминал 1 либо в крыло А, либо в крыло Б. (это легко понять по номеру выхода Ахх или Bxx).
Если прибыли в крыло А, то идете с общим потоком до основной галереи и устремляетесь прямо по коридору по указателям Трансфер/Транзит. Там, где основная масса прибывших вместе с вами начнет сворачивать влево вы все равно двигайтесь по основной галереи и окажетесь между стойками транзита (слева от вас) или крылом В(справа от вас). Смело двигайтесь вперед, по не самому наполненному людьми коридору и вы попадете к стойкам пограничного контроля, вслед за которыми будет досмотр безопасности и опля - вы оказываетесь перед мониторами в терминале 2, где ищите номер выхода на посадку вашего рейса (крыло С будет справа от вас, а крыло D прямо по курсу).
Если вы прибыли в крыло B из Москвы, то с общим потоком идете до основной галереи (поймете, где перед стойкой транзита основная масса начнет сворачивать влево - вам как раз направо и до конца- там погранконтроль, досмотр и посадка на сл. рейс по аналогии с описанным выше.
Если вам почему-то не дали посадочный в Шереметьево, то на уже упомянутой стойке транзита вам дадут посадочный.
С учетом короткой стыковки, возможно, вас будут встречать представители чешских авиалиний, но не стоит на это надеяться.