Довольно сложно что-либо Вам посоветовать, если Вы не знаете какой район Хорватии лучше выбрать... Кому-то нравится Дубровник, кому-то - Истрия, кто-то очень доволен центральной Долмацией. Что касается Букинга, то там количество предложений значительно меньше, а цены могут быть значительно выше, чем на хорватских сайтах (смотрите
Полезные ссылки: Хорватия). Лично я вначале выбирал на основе отзывов, оставленных здесь и на других ресурсах, регион, поселок, искал конкретные предложения (у многих написана возможность использования дворика/сада) и отзывы по ним. После этого списывался с хозяином, уточнял детали, и лишь затем бронировал непосредственно у него. От себя могу посоветовать Шибенско-Книнский район в центральной Долмации - там много небольших уютных поселков и цены на июнь вполне демократичны. Можете посмотреть окрестности Рогозницы, правда, не знаю как там в июне - отдыхал там в сентябре.
Да, не забудьте, что для путешествия на машине в Хорватию Вам потребуются многократные шенгенские визы.