Эээ... там три страны, а не две. И еще: они не любят название "Прибалтика", лучше говорить страны Балтии.
Так-то вот мы с детьми ездили по всему региону, правда, в столицы пытались не заезжать. Вот тут можно посмотреть:
Провинциальная Балтия, 2 неделиЕсли коротко по must see там, то, кроме Вильнюса, Риги и Таллинна, это, примерно, так:
Литва:
Аукштайтийский национальный парк. И река Жеймяна. Ключевые точки: Игналина, Гинучяй, Калтаненай. Лес, холмы, живописные озера и прозрачные реки. Можно арендовать каяк и покататься по лесным речкам.
Этнокосмологический музей в Молетай, место интересное и довольно необычное.
Вильнюс - усадьба Бельмонтас и Павильнисский парк. Высокие обрывы, живописные виды, недалеко от центра города. Еще по Ужупису неплохо погулять.
Тракай - два симпатичных замка, озёра, караимские ресторанчики с вкусной едой и напитками.
Каунас. Ну, тут, если не архитектура и музеи, то просто гулять по Лайсвес аллее, сходить на стрелку Нерис и Немана, попить кофе в замке.
Шяуляй - гора крестов.
Жемайтия - Клайпеда, Паланга, Неринга. Там Куршская Коса, там море. Усадьба Орвидаса - очень странное и интересное место недалеко от городка Салантай. Музей под открытым небом, но очень необычный музей.
Латвия. Ну, тут, кроме взморья, посоветую заехать в Сабиле - там виноградники - и в Кулдигу, отличный старый городок, водопады, латышская Венеция...
В Юрмалу лучше не ездить совсем, а уж если окажетесь, то забиться в дальний ее угол, в устье Лиелупе, природный парк Рагакапа. Лес, дюны, воздух, нет народа.
Эстония. Пляжи Пярну. Самобытные острова Рижского залива: Рухну, Кихну. Изумительный замкнутый ни на что не похожий мир. На машине туда нельзя, надо плыть на пароме. Да и незачем там машина.
На машине можно по другим островам: Сааремаа с пряничным городом Куресааре, мельницы там ветряные, кратеры вулканов, одноэтажное средневековье. Остров Муху - ну там природа и всё.
Еще в Эстонии интересно побережье Чудского озера - район проживания русских староверов.
Ну, как-то так. Вообще, конечно, там куда больше всяких интересных мест. Но на 2 недели хватит с лихвой