Я бы еще порекомендовала побывать в Никко. Про Никко Вы можете найти много информации в Инете. Плюс, что здесь все достаточно компактно расположено и это ближе, чем Киото (1 час на синкасене и минут 40 на электричке).
Но с обязательным посещением озера Chuzenji и водопада Кэгон (можно доехать на автобусе от Tobu Nikko Station до Chuzenji Onsen, который сложно пропусить, за 50 минут по серпантину (высота 70 метров, 48 поворотов). Озеро мне очень понравилось. Кроме, того, мне понравился храм Tachiki Kannon - до него можно дойти минут за двадцать, дорога идет вдоль озера, кстати, там находятся территории посольства Бельгии и еще каких-то стран.
От Токио Вы можете купить Tobu Nikko Free Pass (
http://www.japan-guide.com/e/e2358_002.html), если у Вас нет Japan Rail Pass, или же купить билет на автобус на Tobu Nikko Station в оба конца за 2 000 йен, который дает право проезда в течении дня (или двух, не помню) между Tobu Nikko Station и Chuzenji Onsen с возможностью выхода на любой станции и продолжения поездки.