Нашла три возможных варианта:
1. JR Pass на две недели. Смущает долгий переезд от(и до) Саппоро. К тому же не очень поняла, можно ли от Саппоро по Хакодате ехать с JR Pass
2. Внутренний перелёт Саппоро-Токио и JR Pass на неделю. Цена получается примерно как и в первом варианте, но быстрее. Но JR Pass всего на неделю.
3. Не брать JR Pass вообще. Пользоваться самолётами. Тут вопрос цены. Полагаю, что это самый дорогой вариант.
Может какие-то варианты выпали из моего поля зрения, подскажите.
П.С. еще хочется очень на Фудзи ( как раз открыто, я лечу в августе), но боюсь слишком насыщено выйдет, не успею.