Есть прямыe поездa из Ниццы до Вентимильи(Италия) .Поезда отправляются на каждой 25 -ой и 55-ой минуте часа. Далее внутреитальянским поездом до Пизы ,почти всегда с пересадкой в Генуи.Без пересадки в Генуи возможен только один вариант Ницца 05:25ч - Вентимилья 06:13ч. + Вентимилья 06:33ч -Пиза 11:00ч. Более удачно,по-моему , ехать прямым автобусом компании Volpi из аэропорта Ниццы(11:25ч) до Генуи(15:15) и далее поездом до Пизы.Вот сайт автобусной компании :
http://www.volpibus.com/orari.asp/l/50