Обязательно! Синтра прекрасна, городок-сказка. И на поезде как раз очень удобно. На город не жалко потратить весь день, а при желании можно и заночевать. Недалеко от Синтры - мыс Рока, самый западный мыс Евразийского континента.
В Томаре интересен только замок тамплиеров. На мой взгляд, пары часов достаточно. Ночевать в Томаре - как-то терять время, мне кажется.
Эвора - интересный городок, в частности, знаменитая часовня из костей. Но в целом я бы на город потратила часа три-четыре, наверное.
Очень рекомендую Обидуш - тоже пары часов достаточно, но городок очень колоритный. Особенно узкие улочки в цвету бугенвиллии, ликер жинжа в шоколадных чашечках, крепостные стены.
Про Лиссабон молчу, так как очень его люблю и могу гулять там сколь угодно долго!
Кроме того, я бы обязательно посетила города у океана - Назаре, например, или Кашкайш, потому что обожаю моря и океаны. Но Вы говорите, вам приморские городки неинтересны. Так что выбор за Вами. Хорошего путешествия!