Вернуть карты можно без проблем или зависит от человеческого фактора киоскера?))
"Человеческие факторы киоскера" — несомненно имеют некоторое значение. Но, полагаю, в тех немногих местах где карточку принимают, киоскеры имеют достаточную квалификацию, чтобы отличить пригодную карту, от изнахратенной в конец. Карту в пригодном состоянии — примут без проблем.
И есть ли хороший сайт-планировщик городских маршрутов транспорта ?
Конечно есть. Даже не один. Вот эти два:
https://transport.tallinn.ee/#/ru — пригоден для планирования маршрутов по Таллину и прилегающему уезду.
Этот: http://www.peatus.ee/#route_search поможет при планировании маршрутов по всей стране.
В Таллине и окрестностях, лучше будет пользоваться первым. По-стране — вторым. Но лучше всего спрашивать о конкретных маршрутах тут, прямо на форуме, поскольку тут живые люди, а не роботы имеющие заранее вложенный(подчас не самый лучший) ответ.