Egor_S, 1) могут поставить в стык с предыдущей визой, могут аннулировать и поставить новую визу с даты въезда в Шенген по билетам. Чаще всего первое, но и второй вариант теоретически возможен (не только теоретически, и практически тоже, случаи такие были).
Решение: а) сдвинуть поездку в июне на 3 дня, чтобы ничего не пересекалось или б) подаваться на визу после того как вернётесь из поездки по старой визе. в) надеяться, что консульство не аннулирует визу, а поставит в стык
2) Пишется в свободной форме, просто указывайте причину, по которой не можете сдать паспорт. Что-то вроде этого: я, ФИО, не могу сдать оригинал паспорта номер такой-то в связи с тем, что планирую поездку за границу (или свой вариант). Копии всех страниц паспорта и билеты (или что-то другое) прилагаю. Дата, подпись