Самое сильное впечатление из всего этого однозначно оставила Großglockner Hochalpenstraße. На неё нужен целый день (свободным останется только вечер) + если будете въезжать сюжной части дороги, то увидите ещё и церковь Heiligenblut. Невероятно красиво. В конце дороги вас ждут сурки, что прямо под панорамной площадкой около ледника.
На Криммльские водопады тоже нужен день (тоже где-то до 4-5 вечера). Там три яруса этих водопадов и до верха идти около 3-4 часов. Кажется, до второго яруса за отдельную плату можно на спец.такси, но оно того не стоит, потому что пропустите всё самое красивое. Самые обалденные виды, разумеется, на третьем ярусе. Если хотите просто поставить галочку на тему, что там были, то можно зайти и посмотреть только на 1-ый ярус. Тогда вам там надо всего минут 30.
Ледяная пещера вместе с крепость Hohehwerfen заняли 6 часов (от входа до выхода, без дороги). Правда, не попали на шоу птиц, т.к. оно там всего 2 раза в день (кажется, в 12 и в 15). В 12 мы ещё были в пещере, а в 15 уже не могли, т.к. опаздывали в аэропорт. Про пещеры вам правильно сказали. Впускают туда только в составе группы. Обход самой пещеры занимает час. Частоту заходов точно не помню, кажется, раз в полчаса. Но не уверена. Посмотрите у них на сайте. От места, где вы оставите машину до самих пещер ещё идти и идти. Сначала по тропинке вверх, потом фуникулёр, потом снова долго вверх уже в снегах. Потом ещё ждёте заход с группой.
При таком раскладе, с учётом, что у вас всего 3 свободных дня (вы сам Зальцбург не смотрите, что ли?), я бы вам посоветовала честно выкинуть Мюнхен, потому что одного дня на Мюнхен всё равно категорически мало. Лучше составьте маршрут по природным достопримечательностям, а в Мюнхен езжайте как-нибудь отдельно: например, на Октоберфест, совместив это с Нойшванштайном, Кёнигзее и Орлиным Гнездом (там тоже невероятно красиво). Не разбрасывайтесь так. Посмотрите в этот раз только австрийские красоты. Они действительно того стоят!