Насколько я понял из Вашего поста, гостиницы по маршруту у Вас не забронированы. Если для Прибалтики это не столь существенно - свободные места найти можно, то вот, например, в Праге найти сейчас что-то по приемлемым ценам весьма затруднительно. Кроме того, имейте в виду, что в большинстве европейских городов парковки платные и часто недешевы, особенно в центре.
Что касается Вашего маршрута.
От Кохтра-Ярве до Таллинна около 2 часов хода, от Таллинна до Риги - 4 часа, правда, в связи с дорожными работами на бывшем погранпереходе Икла, там можно потерять до получаса (так было у нас на прошлой неделе).
Путь от Риги до Берлина занимает порядка 16 часов с учетом необходимых остановок, т.е. при двух водителях вполне проходим за один раз. Ехать лучше всего по трассе Е67 до Августова, далее, на мой взгляд, – уйти на Ломзу с выходом на ту же трассу (E67/S8) у Острова Мазоветски и далее на Варшаву, оттуда по А2 до Берлина.
Однако, я бы предложил Вам разбить его на два участка: Рига - Вильнюс (время в пути порядка 4 часов), осмотр города и, может быть, ночевка, и Вильнюс - Берлин (время в пути порядка 14 часов).
Вообще, почитайте ветки
в разделе автопутешествий – думаю, найдете ответы на большинство своих вопросов, в т.ч. по виньеткам. Каких-то знаков, предупреждающих об их обязательности, что-то не помню.
Со своей стороны, исходя из Вашего лимита времени (11 – 12 дней), я бы не советовал посещать много городов, поскольку на каждый большой город, на мой взгляд, надо по крайней мере 2 дня, а Вы даже на Берлин отводите только день. Думаю, можно ограничиться Прагой и, например, Краковом с посещением Велички, а оттуда направиться в Минск.
И еще, не забывайте, что на дорогах Прибалтики и Польши установлено довольно много камер, фиксирующих превышение разрешенной скорости, причем, разных типов, но практически везде есть знаки, предупреждающие о них.